MID INFRARED SPECTROMICROSCOPY (MID-IR)

import matplotlib.pyplot as plt

import numpy as np

from Orange.data import Table

from orangecontrib.spectroscopy.data import getx

spectra = in_data.X

energy = getx(in_data) #This is specific to getting data from Orange data files

###############################################################

fig, ax = plt.subplots()

###############################################################

ax.plot(energy, spectra[0], 'indigo', linewidth=1.0, label='label indigo line text')

#add label='label text' if you want to add a legend

#choose colour

#choose line width

###############################################################

#add title

title = ax.set_title('Awesome test plot',fontsize='10', loc='left') # location = centre, left, right (default is centre)

###############################################################

#add axis labels

ax.set_xlabel('Wavenumber / cm$^{-1}$', fontsize='12')

ax.set_ylabel('Absorbance', fontsize='12')

###############################################################

#set axis limits -->can use to reverse axis for IR spectra

ax.set(xlim=(1850, 850)) #this is the wavenumber region you want to show

ax.set(ylim=(0,1)) #this is the absorbance range

###############################################################

#add legend

ax.legend() #if you added label text use this to make a legend

###############################################################

plt.show()